第285章 这还是化学问题吗 千越南秋
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「我们接下来需要做的事很明确,根据这组模型输出的数学约束条件,逆向设计出全新的蛋白质骨架。」
徐铭站在主讲位置,身后的屏幕中,显示出多尺度动态计算模型,通过超级计算机不间断演算一个月,最终输出的理想活性口袋约束条件。
现场众人中,国际数学挑战研究院议题组员,因为早已经看到过这项约束条件。
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神情上并无多少变化。
反观化学研究所这边,包括周启深院士在内,大家都下意识微皱眉头。
尽管他们在极紫外光刻胶后,都愿意相信徐铭。
认为酶催化,并非现代化学的绝症,是能够将其成功解决的。
但看到屏幕上面,那一系列拓扑描述符,与静电势等高线图和氢键网络连接矩阵,以及用张量表示的金属配位场参数条件。
俨然已经超出了化学表达范围。
「这真的还是化学问题吗?」坐在化学所中间的路川忍不住低喃一句。
仿佛对构建全新蛋白质结构的难度有了一个认知。
显然并非一件容易的事。
徐铭讲述时,也在注意着大家的表现,前脚话音落下未做停顿,便又用化学语言对约束条件进行讲解。
「周院。」
「根据模型输出的约束条件,需要一个大约150个胺基酸的小蛋白,它要能在水溶液中稳定折叠,核心有一个直径08纳米的疏水口袋。」
「口袋内壁的静电势梯度必须满足这个函数。」
讲到这里,徐铭快速切换画面。
下秒一条复杂的曲线出现。
「在坐标x02纳米处,电势要为-15毫伏;x05纳米处,转为+8毫伏;
「口袋最深处金属簇的结合位点,电势必须接近零。」
随着他的讲解,周启深等人陷入思考状,目光牢牢注视着屏幕满脸认真。
而就在这时,路川嘴唇微动,略作犹豫还是选择了主动开口搭话。
「徐院长。」
「天然固氮酶的活性口袋,似乎并没有这么精确的静电梯度?」
说出自己心中的疑问。
徐铭把这句话听进耳中,顿时投去一个欣慰眼神。
接着嘴角爬上笑容,沉声给予回答。
「因为天然酶不需要。」
「我们的动态计算模拟显示,二氧化碳分子在进入活性口袋时,其碳氧键的极化程度会随着位置变化。」
「这个静电梯度是为了在特定位置『拉伸』碳氧键,降低其断裂能垒。」
「我明白了。」路川猛地点头回答。
眼中浮现出,从徐铭这里学到新东西的欣喜。
会议进行到这里,相关流程和方案,基本算是初步确定下来。
对此徐铭和周启深也没过多耽搁时间,随即宣布散会后便立刻开始投入实验。
只等化学所根据这些数学约束条件,创造出物理世界中的对应物。
……
之后两周时间里,化学所的蛋白质设
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